在全人类被石化的世界里，科学少年千空为了救出挚友，必须用火药武器对抗武力至上的司帝国。
续接第一季，千空与司帝国的战争进入白热化。为了解救被石化的冰月等人，千空决定不再躲藏，而是利用科学正面进攻。在没有硝石的情况下，他利用鸟粪制造火药，制作出原始的“科学之枪”。同时，为了策反司帝国的大将，千空展示了制作拉面、温泉甚至手机的技术，用“便利性”瓦解敌军的意志。最终决战中，千空用闪光弹致盲敌人，以不杀一人的方式制服了司。就在两人握手言和准备复活全人类时，远方传来了奇怪的电波信号——这个世界上，还有别的石化幸存者势力。
理科生的浪漫在这部番里发挥到了极致。看千空从零开始造手机的过程比看神仙打架还过瘾。节奏飞快，每一集都有新的科技突破，让人看得欲罢不能。
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